Lo scopo di un'indagine archeologica è ottenere informazioni originali che, dopo analisi e interpretazioni, possano aumentare la conoscenza e la comprensione del nostro passato. Per raggiungere l'obiettivo è importante la scelta e l'applicazione del metodo e della tecnologia. Nel 1981, il Museo della contea di Kalmar iniziò le indagini archeologiche marine della nave reale Kronan.
I pozzi di prova sono stati scavati in posizioni strategiche sul sito del relitto per determinare l'estensione e la natura dei reperti. Un sistema di coordinate è stato stabilito su un'area di 50 × 40 metri con il relitto al centro. Il sistema di coordinate consente la misurazione e la determinazione della posizione in base a punti fissi, oggetti trovati e parti di costruzione. Una volta installato il sistema di coordinate, è iniziato uno scavo sistematico e graduale del relitto, ponte dopo ponte in direzione della nave lunga. A metà degli anni '90, un cosiddetto pozzo di ricerca è stato prelevato attraverso il relitto, al fine di chiarire dove correvano i confini del ponte nelle parti più profonde e inferiori del relitto. Oggi, dopo 40 anni di rilevamenti annuali, sono stati censiti circa 95 % della superficie del sito del relitto. Sono stati recuperati 35.000 oggetti.
Gli oggetti e le strutture sul sito del relitto vengono esposti con una cosiddetta pompa di aspirazione dei fanghi o mastodontica. Con l'aiuto di un compressore, l'aria compressa viene condotta in un tubo flessibile sul fondo, dove l'aria viene immessa in un ugello metallico tramite una valvola. Quando l'aria aspira alla superficie attraverso il tubo di aspirazione grossolano, si crea una pressione negativa e gli oggetti possono essere esposti da sabbia, fango e argilla. Prima di raccogliere un oggetto, deve essere misurato ed esposto completamente. Altrimenti c'è il rischio di perdere informazioni importanti. In superficie, l'acqua passa dal tubo di aspirazione attraverso un setaccio dove è possibile smaltire eventuali oggetti trascurati. È della massima importanza che il subacqueo non lavori con l'ugello a diretto contatto con l'ambiente di scavo. Gli oggetti possono quindi essere facilmente danneggiati o scivolare nella bocchetta di aspirazione. È anche importante che il subacqueo stia il più fermo possibile durante il lavoro in modo che il sedimento non si muova verso l'alto e distrugga la vista sul fondo. Esiste anche il rischio che gli oggetti vengano distrutti per negligenza durante lo spostamento. Prima di raccogliere un oggetto, deve essere misurato ed esposto completamente. Altrimenti c'è il rischio che le informazioni importanti vengano distrutte.
Un cosiddetto mosaico fotografico costituito da un patchwork di immagini digitali del sito del relitto, mostra l'aspetto del sito del relitto. Le riprese sono state effettuate con una fotocamera fissa da una certa distanza dal basso. Le immagini vengono quindi assemblate con l'aiuto di un programma per computer. L'immagine finita del relitto serve come base per identificare le diverse parti del relitto e facilita anche la pianificazione del lavoro di immersione. Sulla base del fotomosaico e delle misurazioni sistematiche di diverse parti del relitto, viene progressivamente redatto uno schizzo sempre più dettagliato del sito del relitto. Collegando l'immagine digitalizzata del relitto con un database di oggetti in cui sono inclusi tutti i reperti, la posizione dei reperti recuperati può essere visualizzata sullo sfondo dello schizzo.
Quando ci si immerge a profondità superiori a 10 metri, il tempo è limitato. Al sito del relitto di Kronan a una profondità di 26 metri, il tempo massimo di immersione è di 30 minuti, per effettuare una risalita diretta. Dopo alcune ore in superficie, è possibile effettuare una seconda immersione più breve. Il tempo effettivo di immersione è di circa 50 minuti al giorno e subacquei. Il gas respirabile è normale aria compressa. Ogni subacqueo usa una cosiddetta muta stagna. Sotto la muta, i subacquei indossano una rastrelliera in fibra, per proteggersi dal freddo. La temperatura del fondo nel sito del relitto raramente supera i +5 gradi.
Il breve tempo di immersione richiede una pianificazione molto attenta del lavoro sul fondo. Poiché l'immersione non è fine a se stessa ma solo un modo per "mettersi al lavoro", le abilità subacquee devono essere nella "spina dorsale" e l'archeologia deve essere messa al primo posto. Una squadra di sommozzatori è composta da 20 subacquei più l'equipaggio della nave. Le immersioni si svolgono per lo più in coppia. I compiti da svolgere sono attentamente pianificati in superficie prima della discesa. Non è solo un lavoro puramente archeologico che viene svolto sul fondo. Molti lavori di assistenza e manutenzione devono essere eseguiti continuamente affinché il lavoro archeologico funzioni. Nella base per le immersioni devono esserci anche routine di sicurezza ben funzionanti.